在過去的20年里,有三次嚴重流行性冠狀病毒的爆發。SARS-CoV導致嚴重急性呼吸系統綜合征(非典型肺炎),2002年起源于中國,造成800多人死亡;MERS-CoV導致中東呼吸系統綜合征,造成850多人死亡;以及SARS-CoV-2導致新冠病毒疫情,造成380萬人死亡。
亞利桑那大學的一項新研究發現,2萬多年前在東亞地區爆發了一場冠狀病毒疫情,在該地區人們的基因構成中可以看到疫情的痕跡。
研究人員分析了來自全球26個人群的2500多名現代人的基因組,以更好地了解人類是如何適應歷史上冠狀病毒爆發的。研究團隊使用計算方法發現了適應冠狀病毒的遺傳痕跡。這項對人類基因組進化的研究揭示了一場大型冠狀病毒流行在數千年前就已經爆發了。
研究團隊在不使用活細胞的情況下,合成了人類和SARS-CoV-2病毒蛋白,并顯示這些蛋白的相互作用,指出了冠狀病毒用來入侵細胞機制的保守性。現代人類基因組包含可追溯到數十萬年前的進化信息,包括讓人類能夠在病毒的新威脅中生存的生理和免疫適應。
研究結果顯示,東亞人的祖先經歷了類似于新冠狀病毒引起的疾病流行。東亞人來自現在的中國、日本和韓國等地區。
為了入侵細胞,病毒必須附著并與宿主細胞產生的特定蛋白質相互作用,這些蛋白質被稱為病毒相互作用蛋白,或VIPs。研究人員在編碼VIPs的42個不同人類基因中發現了適應疫情的跡象,表明現代東亞人的祖先在2萬多年前首次接觸到冠狀病毒。
研究人員還補充,研究發現這42個VIPs主要活躍在肺部——受冠狀病毒影響最大的器官組織,并證實它們與當前流行的病毒直接互動。除了位于宿主細胞表面并被冠狀病毒用來進入細胞的VIPs外,病毒一旦進入細胞后還會與其他許多細胞蛋白相互作用。
研究人員表示,那些為防止或幫助病毒繁殖的蛋白質編碼人類基因,在大約2.5萬年前經歷了比預期更多的自然選擇。
研究古代病毒留下的“足跡”,可以幫助研究人員更好地了解不同人類群體的基因組如何適應病毒(那些已經成為人類進化重要驅動力的病毒)。這項研究可以幫助識別在遙遠的過去和未來可能造成流行病的病毒,有助于研究人員編制一份潛在危險病毒的清單,然后為它們的再次出現開發診斷方法、疫苗和藥物。
題為An ancient viral epidemic involving host coronavirus interacting genes more than 20,000 years ago in East Asia的相關研究論文發表在《當代生物學》雜志上。
前瞻經濟學人APP資訊組
論文原文:
https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(21)00794-6?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982221007946%3Fshowall%3Dtrue