雖然人們普遍認為VR(虛擬現實)設備是僅限于專門的游戲玩家使用的昂貴產品,但近年來VR設備已經越來越便宜,入門級硬件(如Google Cardboard)的價格不到10美元。有了這種頭盔,任何擁有智能手機的人都可以將他們的設備放入頭盔,并通過其大屏幕觀看VR內容。
隨著門檻大大降低,科學家和工程師們正試圖將VR帶給大眾,并利用它來解鎖突破性的發現。來自美國一些頂級醫療中心和機構的一個研究團隊現在在《遺傳學前沿》上發表了一篇論文,記錄了他們創建的名為“singlecellVR”的VR工具,它可以供任何人探索單細胞的數據集。
這個免費、開放的網絡應用允許任何人在VR中輕松實現單細胞檢測的可視化,而且還不需要用戶具備高級技術技能。單細胞檢測改變了人們在細胞群內建立異質性模型的能力,有助于在更大的細胞群中確定單個細胞的功能和行為。
獲得這些數據并確定細胞狀態和基因至關重要,它可以幫助科學家更好地進行理解,包括各種癌癥在人體中的傳播方式。
以前的工具非常昂貴,成本高達2500美元以上。然而,singlecellVR建立在以前的VR進展之上,允許用戶直接通過最常用的單細胞分析工具(包括Scanpy、Seurat、PAGA、STREAM、scVelo和EpiScanpy)將他們自己預先計算的數據可視化。
基于智能手機的VR頭盔在用戶導航和與數字環境的互動方面受到限制,但研發人員說,增加一個便宜實惠的藍牙鍵盤或控制器(大約20美元)可以帶來更好的體驗。
展望未來,該團隊認為singlecellVR將會有更多單細胞技術相關的應用(例如多組學或空間剖析),它們期望singlecellVR能擴大對更強大設備的支持,例如Facebook的Oculus VR頭盔,其成本約為300美元。
該研究論文題為"singlecellVR: interactive visualization of single-cell data in virtual reality",已發表在《遺傳學前沿》期刊上。
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參考資料:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2021.764170/full